本基金會係由行政院動支90年度第二預備金所設立，於91年2月5日完成設立登記。102年7月配合行政院組織改造,本基金會之主管機關變更為衛生福利部。
本基金會設立之主要目的係以運用社會資源，統合民間力量，協助因天然災害受災地區之賑災為宗旨。為妥善運用與管理賑災捐款,本基金會以客觀、超然立場統籌運用各界賑災捐款,彌補政府在防救災體系中不足之處，使防救災工作更臻完善,期受災民眾在各界愛心關懷之下，得以早日度過難關、重建家園。
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